A principios de siglo XXI, la Escuela N°16, debe arreglar su patio ya que como en otras ocasiones se estaba hundiendo, la Intendente en ese momento Laura Giagnacovo de Gallardo, Profesora de Historia, solicita que antes de la remodelación se realice un estudio arqueológico del lugar para corroborar los dichos populares sobre que los túneles unían la actual Escuela N°16 con otros lugares del pueblo.

La U.N.L.P. y el Instituto Cultural de la Provincia de Buenos Aires son quienes desarrollan el trabajo de campo e investigación arqueológica en el lugar. En su “Análisis Interinstitucional sobre Materiales Constructivos provenientes del Sitio Arqueológico Escuela Nº 16 de San Miguel del Monte, Provincia de Buenos Aires” expresan:

“…Respecto a los arcos y restos de estructuras encontradas en el patio, corresponderían a cimentaciones de edificios importantes y/o pasadizos. Utilizados para ocultar armas o alimentos, correspondientes a los siglos XVII y XIX”. (Informe técnico emanado del Departamento de Preservación de la Dirección Provincial del Patrimonio Cultural, ex Subsecretaría de Cultura de la Dirección General de Cultura y Educación de la Provincia de Buenos Aires).

La finalidad de los túneles es incierta, ya que pudieron haber sido usados como reservorio de agua o una vía de escape en caso de que el fortín fuera tomado durante un “Malón”.

Junto con estos túneles se encuentran los cimientos de la “Iglesia de la Divina Pastora de Monte” que Juan Manuel de Rosas (1793-1877) hizo reconstruir en 1829 debido a que sucesivos “Malones” o por el paso del tiempo habrían deteriorado su estructura ya que se encontraba en funcionamiento desde 1778. Se inauguró un 25 de mayo de 1831 y fue demolida en 1852 luego de su derrota en la batalla de Caseros (3 de febrero de 1852), esta Iglesia se encontraba frente a la plaza de armas que es donde el ejército y en este caso La Guardia del Monte realizaba ejercicios y depositaban algunas de sus armas.

Hasta el día de hoy no se conoce la totalidad de las dimensiones del túnel ni de la Iglesia.